中午到了南京后可以先订好住宿，最好订在夫子庙附近吧，这样交通也比较方便。就以你住夫子庙周边为出发点来介绍吧，
1.第一天下午去中山陵和明孝陵。时间有点紧，不过也可以逛完。夫子庙坐地铁一号线（三山街站点，在中山南路上哦）到新街口转地铁2号线，在苜蓿园下车，可步行到明孝陵。明孝陵门票以前好像是60，学生半价（不含研究生哦）。逛完后步行或者做景区的车到中山陵，以前公交可以到的，现在公交上不了山了，还是步行吧，约半小时，一路上大树参天，很美的景色。中山陵就是爬上个高梯子就到了，玩下来半小时，现在免票。回来走到苜蓿园地铁站，或坐景区车，貌似要5元还是10元，原路返回夫子庙。
2.晚上在夫子庙附近吃回味鸭血粉丝，在瞻园路那个夫子庙门附近，味道不错，然后去夫子庙逛夜景，很不错的，很多小吃。那里可以坐船游秦淮河。
3.第二天，上午可以起来看看白天的秦淮河。在夫子庙站（在健康路上那个站，平江府路口）或三山街（长乐路上那个站）坐4路直达朝天宫。
4.朝天宫上午就玩完了，可以坐4路去新街口西站，走到新街口，逛南京的商业区。在新街口吃饭，然后下午坐地铁1号线到玄武湖公园去玩玩，也是免票的。逛完后差不多就傍晚了，火车站就在湖边，嫌难走就坐地铁去火车站。
如果时间充足的话，其实可以去看看浦口火车站，抗战时期的重要车站，现在已经荒废，但很多电影电视都会去取景，很幽静的地方，古老的月台和破旧的绿皮车。